Ada enam hal yang perlu diperhatikan dalam rencana nasional jangka panjang Indonesia untuk mengembangkan wilayah Jabodetabek-Punjur sebagai kohesi spasial sosial, lingkungan, dan ekonomi ke dalam struktur tata ruang yang fungsional dan layak huni: masalah banjir, ketersediaan sumber air, sanitasi dan sampah, masalah reklamasi pesisir dan pulau, kemacetan, dan relokasi ibu kota.